Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms