Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms