Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF5P84085 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF5P84085 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF5P84085 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF5P84085 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF5P84085 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF5P84085 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms