Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms