Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms