Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms