Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT2P45379 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms