Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGCXP38435 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms