Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms