Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms