Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms