Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms