Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PLNP26678 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms