Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms