Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN8P19075 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms