Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPB42P16452 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPB42P16452 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPB42P16452 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms