Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF35P13682 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF35P13682 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF35P13682 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF35P13682 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF35P13682 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF35P13682 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF35P13682 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF35P13682 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms