Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP4P12644 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms