Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms