Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD1P0DJD0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms