Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3P09919 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSF3P09919 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF3P09919 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms