Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB7P09629 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms