Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFNB1P01574 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms