Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms