Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG7O95352 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG7O95352 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG7O95352 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms