Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTSS1O43312 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTSS1O43312 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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