Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms