Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF25A6NGN4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms