Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms