Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms