Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms