Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms