Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNAL1Q9UBT7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms