Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms