Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms