Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms