Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZMAT3Q9HA38 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms