Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms