Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM8Q9BZR9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms