Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms