Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms