Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms