Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SENP8Q96LD8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms