Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms