Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms