Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms