Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BEST4Q8NFU0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BEST4Q8NFU0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BEST4Q8NFU0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BEST4Q8NFU0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BEST4Q8NFU0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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BEST4Q8NFU0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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BEST4Q8NFU0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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