Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms