Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms