Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms